草薙 素子(Motoko Kusanagi) CV：坂本真綾

超ウィザード級のハッカースキルを持つ完全義体のサイボーグ。荒巻からの公安９課への異動の誘いを断って自身の部隊を設立し、正式認可に向けて雇われ部隊として活動中。

荒巻 大輔(Daisuke Aramaki) CV：塾一久

通称“部長”と呼ばれる公安９課の長。テロなどの国家安全を脅かす凶悪犯罪を未然に防ぐために内閣総理大臣直轄の攻性の捜査機関設立を目論んでいる。

バトー(Batou) CV：松田健一郎

“眠らない眼”と呼ばれる義眼を持つ全身義体の元特殊部隊員。戦場を渡り歩き、数々の戦闘経験を持ち、特に電子戦を得意とする。戦場で草薙とも顔を合わせているらしい。

トグサ(Togusa) CV：新垣樽助

元新浜県警刑事部の特捜刑事。電脳化はしているが体はほぼ生身であり、妻帯者である。状況の積み重ねによる推理考察を得意とし、リボルバー「マテバ」を愛用している。

イシカワ(Ishikawa) CV：咲野俊介

元陸軍情報部の大尉。経験豊富なベテラン。主にハッキングやネットの情報解析などの任務や支援を行い、防壁からウィルス、ワクチンの作成までも対応する。

サイトー(Saito) CV：中國卓郎

元海兵隊のエース・スナイパー。狙撃に特化した義体を持ち、左目の狙撃支援システム「タカの眼」で衛星とリンクし、長距離弾道狙撃を可能としている。ギャンブル好き。

パズ(Paz) CV：上田燿司

元陸軍警察の潜入調査員。ナイフなどの近接格闘術を得意とし、内偵調査などで培った経験から、人を欺くことに長ける。旧態依然とした組織の中で能力を生かす場を求めていた。

ボーマ(Borma) CV：中井和哉

陸軍空挺特科第一出身の元特殊部隊員。爆発物を扱った特殊工作などを行なっていた。電子戦の技術や、ネットの捜査能力も高い。外見とは裏腹に繊細な性格の持ち主である。

ロジコマ(LOGICOMA / Logistics Conveyer Machine) CV：沢城みゆき

コンテナ内部に武器や弾薬などを収容する熱光学迷彩装備の歩兵兵站用輸送支援車両。指揮官を識別し自律支援する程度の人工知能を持つ。公安９課に試験配属されている。

クルツ (Kurutsu) CV：浅野まゆみ

陸軍５０１機関の長。義体化部隊を率いて草薙とともに任務をこなしてきたが、上官の死により指揮をとることに。戦後の組織再編が進む中、５０１機関の存続に尽力している。

ツムギ (Tsumugi) CV：野島健児

陸軍５０１機関所属の電子戦の戦術士官であるサイボーグ。一卵性双生児の２人の脳をひとつの義体に載せた電脳を持ち、常に対話と思考をしているらしい。

クリス (Chris) CV：藩めぐみ

養護施設の少女。

藤本修（Osamu Fujimoto) CV：NAOTO（EXILE / 三代目 J Soul Brothers）

藤本彰内閣総理大臣の長男。首相の補佐官を務める。

ロバート・リー(ROBERT LEE) CV：麦人

東亜連合経済体の極東通商部代表。悪名高いフィクサーで、米国からの命で国外追放されかけたこともある。